为了解决这起案件，一位穿着一身显眼服装，名叫「隐神」的男子，被从东京找来到此地。暴躁冲动却富有激情的拉斐尔（乔什·帕斯 Josh Pais饰），幽默风趣的的米开朗基罗（迈克林·西提 Michelan Sisti饰），个性沉稳的多纳泰罗（雷夫·提勒顿 Leif Tilden饰）以及他们的领导者达芬奇（大卫·福尔曼 David Forman饰），这四只功夫高强的忍者龟便肩负起为纽约市除暴安良的神圣使命。

在这里，这群都曾坠落在黑暗里的男孩与女孩，在相互的羁绊和纠缠中，友谊、信仰和爱情似乎正在隐约凝成一道看不见的光柱，在无形中悄然的指引着他们脱离从前。时隔七年，当年这些天真无邪的孩子们，刚刚长大。

在金钱面前，绫子可谓不遗余力，想尽了各种办法。逃亡途中，戚明星救起了一名手上的青年，他的真实身份正是司马鑫的女婿卓一帆（傅声 饰），两位侠肝义胆的志士一拍即合，不仅将前来追杀的刺客悉数歼灭，更杀回了越西鸿的老巢，誓要为江湖除害。

郑惠成则饰演"国巫党"巫华一角。可无论庄敦大如何的冷漠和毒舌，深受其害的片桐音还是一心一意的喜欢着这个大男孩，虽然常常会被不安全感折磨，但心意相通的两人总能成功的化解误会。

然而，面对两人之间巨大的悬殊，太逸能够坚持他的感情吗？与此同时，接二连三发生的意外亦让太逸的生活陷入了麻烦之中。在那不勒斯，凯瑟琳游览了庞贝古迹和各种博物馆，来自过去的文明的冲击之下，凯瑟琳的思想渐渐产生了变化。

可是未过多久，丹西即被神秘之人残忍杀害，戴夫的命运也令人堪忧。即使如此也为了再次筑起羁绊，而伸出手去的被选召的孩子们，与回应此的数码宝贝们。